预付款融资通常是基于核心企业的业务进行，核心企业是属于生产型企业，下游采购商给核心企业下订单，需要预支付订单全额，核心企业收到货款后再进行生产。
此时如果采购缺资金情况则无法进行下订单。
在这个基础上，金融机构介入在供应链环节中，提供预付款融资产品。
采购商只需要支付一定比例的保证金，剩余资金由金融机构进行垫付。
在生产完成，货权控制在核心企业手中，采购商在进行提货时，必须先还款给金融机构，金融机构开具放货通知单。
核心企业接收到放货通知单再进行放货。
如果下游采购商违约，则需要由核心协助金融机构处理货物，将货物处置完成后的资金，再还款给金融机构。
预付款融资交易结构（根据金融机构要求会有不同的改动）
预付款融资模式主要是以生产型企业为主，金融机构已经介入到供应链环节中，核心企业协助金融机构完成整个融资流程。
研究金融与供应链企业协同发展之道，既是解决中小企业困境、实现“供应链”共赢的要求，也是金融企业进行业务创新、提升竞争力的有效途径。在此背景下，供应链金融作为一项商业银行的业务创新日益受到市场的关注。
目前，供应链金融尽管在很大程度上减少了中小企业受信中的道德风险。但是，由于供应链融资中的中小企业自身抗市场风险能力较弱，且供应链金融参与者众多，而且可能涉及不同的产业、技术领域，其运作存在的一些潜在风险不容忽视。
在某个产业供应链中，中小企业总是围绕核心企业进行运营和合作，其现金流缺口也主要产生于应收账款、支付预付账款以及库存仓储期间，而这个资金缺口期间却又往往沉淀了大部分流动性和无形资产。