营养也是影响小儿生长发育的重要因素之一。充足和调配合理的营养是小儿生长发育的物质基础，如营养不足则首先导致小儿体重不增甚至下降，终也会影响身高的增长和身体其它各系统的功能，如免疫功能、内分泌功能、神经调节功能等。而且年龄越小，受营养的影响越大。
疾病对小儿生长发育的影响也十分明显，急性感染常使体重不增或减轻，慢性感染则同时影响体重和身高的增长。内分泌疾病(如甲状腺功能减退症)对生长发育的影响更为突出，常引起骨骼生长和神经系统发育迟缓。先天性疾病(如先天愚型)对小儿体格发育和智力发育都会产生明显影响。
微量元素硒对儿童生长发育的影响
我国是一个缺硒大国，72%的地区都是缺硒地区。硒是人体必需的一种微量元素，是绝不可或缺的。尤其是儿童这一特殊群体，正处于生长发育的关键时期，对微量元素硒的需求也相对比较旺盛。一旦缺乏了微量元素硒，将会对儿童的生长发育造成不可挽回的影响。
微量元素是相对主量元素（大量元素）来划分的，根据寄存对象的不同可以分为多种类型，当前较受关注的主要是两类，一种是生物体中的微量元素，另一种是非生物体中（如岩石中）的微量元素。