是指要求海关对其知识产权实施保护的权利人，将其知识产权的法律状况、有关货物的情况、知识产权合法使用情况和侵权货物进出口情况以书面形式通知海关总署，以便海关在对进出口货物的监管过程中主动对有关知识产权实施保护。根据2003年12月修订的《知识产权海关保护条例》，知识产权备案不再是海关对知识产权实施保护的前提，未进行知识产权备案的权利人仍然有权向口岸海关申请扣留进出口的侵权货物。但是，事先是否进行知识产权备案，在实践中有很大的差异。
是海关采取主动保护措施的前提条件。根据《条例》的规定，知识产权权利人如果事先没有将其知识产权向海关备案，海关发现侵权货物即将进出境，也没有权力主动中止其进出口，也无权对侵权货物进行调查处理。预防将来可能的侵权行为发生。由于海关对进出口侵权货物予以没收并给予进出口企业行政处罚，尽早进行知识产权备案，可以对那些过去毫无顾忌地进出口侵权货物的企业产生警告和震慑作用，促使其自觉地尊重有关知识产权。
注册为系统用户
为减少知识产权权利人申请时间和提高海关总署审核备案申请的效率，除特殊情况外，目前知识产权海关保护备案申请都应当通过“知识产权海关保护备案申请系统”提交。所以，备案申请人在提交备案申请前首先要注册为系统用户。系统用户应当以知识产权权利人的名义进行注册，填写必要的用户信息，以获取系统账号和密码。
补正申请
海关总署在收到申请人邮递的纸面申请后才开始进行审核。但是申请人可以通过备案系统随时了解海关总署受理、审核、核准和驳回申请的全部过程。申请人可以根据海关总署驳回申请的意见，对其申请进行补正。
收到核准或者驳回申请的通知
根据《知识产权海关保护条例》的规定，海关总署应当在自收到申请人提交的全部申请文件之日起30个工作日内将做出核准或者驳回申请的决定。海关总署核准或者驳回备案申请，都应当向申请人发出书面通知。海关总署驳回申请的，不退还原申请文件。