履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。
保函费指工程合同造价的10%(各银行要求可能不同)的甲方银行支付保函费，乙方10%的履约保函以及5%的民工工资保函所产生的费用，如果直接去行办理银行保函，银行会收取手续费，或找担保公司代理，也会产生一定的费用，也可以叫保函手续费。
差额保函：为防止投标人低价抢标，招标文件会设置一个风险控制价(一般为招标上限价的85%，亦有例外，具体看招标文件规定)，凡低于该风险控制价的，中标人在提交履约保证金的同时必须额外提交中标价与风险控制价之间的差额担保，可以用保证金的方式，亦可用保函的方式，用保函方式提交的，该保函即为差额保函(风险控制价-中标价=差额)。一般差额保函金额超过中标价的20%，风险较大，原则上不予办理。
保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证，为被保证人投标、预约报修、支付工程款等行为担保，保证在其未能履约时，保证人代为履行义务或者赔偿损失。保函是保证人、保函受益人、合同的债权人达成的协议，是保证合同的一种表现形式。