重要的是要有一套运行有效的生态过滤系统，其中包括机械过滤和生物过滤。通常的机械过滤只能去除固体污物，而溶于水中的还有大量的，如蛋白之类的有机物是无法滤清的，只有靠生物过滤系统才能完成。
鱼缸里的水会因鱼类的粪便、食物残渣、水草腐叶而受到污染。在人们想象中将水中看得见的悬浮物过滤掉，使水保持清澈透明就已达到目的，其实这仅仅只是过滤的初级功能，我们通常称之为机械过滤。现代的观赏鱼缸过滤应是同时具有机械过滤和生物过滤，有时还需要物理过滤。其中尤为重要的是生物过滤。所谓生物过滤，就是通过附着在滤材上的，将溶解在水中的有害物质分解或转化为无害物质。物理过滤则是利用某些材料特有的吸附功能使水净化。物理过滤只在特殊情况下短时间使用，如为了去除水中的剩余药剂等。
市场有些劣质饵料，为增加卖相会加入色素，喂用时饵料中的色素溶入水里，就使水变为色，如出现此情况就应更换饵料才能沏底解决。
水草也是净化水体的好帮手，应该尽量多养水草，使整个水族缸变成一个小小的生态乐园，水体自然就变得十分清澈。
在缸中投放清道夫和食苔虾，它们能清除附着在缸壁上的污垢和藻类，使缸壁清晰。
刚买回来的热带鱼，不能立即放入已有鱼的鱼缸中。应将鱼和盛鱼的容器一起放入鱼缸约半小时，使前者和后者的水温一致，然后再将鱼放入鱼缸。鱼缸中的水温一般应保持在25℃左右。鱼缸中鱼的密度不宜过大。如果鱼缸中的水表面有一层灰白色的沉淀物，就应该换水。自来水和开水不能直接注入鱼缸，要将二者混合放凉，或者将自来水放置3～4 天后和开水混合，当其温度与鱼缸中的水温相接近时，方可注入鱼缸。鱼食是活虫，一次投食不宜过多，投两次即可。