恶意的程序：大家熟悉的恶意程序就是病毒，很多人认为病毒对数据的影响仅仅是病毒的破坏性，这是不正确的，实际上病毒的感染本身就是一种破坏，一个病毒无论他借助修改你的引导区、可执行程序还是OFFICE文档，他都把你正常的数据做了改变，当然，你可能举良性伴随性病毒这种极端的例子。但毫无疑问，他同样对数据构成了破坏，至少他减少了你的硬盘的可用空间。同时，恶意的程序还包括特洛伊木马，逻辑炸弹等等。恶意的程序造成的破坏可能是难恢复的。
其他恶意的破坏，即使不借助病毒或者其他的工具，只要拥有足够的权限，任何系统都有一定的“自毁”能力。比如依靠系统正常的删除、移动、格式化等操作也可以达到破坏数据的目的。随着网络技术的发展，威胁已经不仅于本机。
操作系统或应用软件的错误：随着操作系统和应用程序的代码量的成倍增加，BUG也在不断增加。我们常用的桌面系统WIN9X就是一个BUG大王。操作系统和应用软件的错误，往往会给人的工作带来一些不可预期的影响。比如前阶段，发现FRONTPAGE98的一个BUG，触发后会把你目录下的文件全部删除，另外，象的游戏神话II，出现了如不安装在默认目录中可能会使你丢失扩展分区这样严重的问题。
NDD：常见的FAT文件结构磁盘修复工具，就是的NORTON磁盘医生，可以自动修复分区丢失等情况，可以抢救软盘坏区中的数据，强制读出后搬移到其他空白扇区。希望大家不要再使用NORTON FOR DOS7或8的NDD，这个版本由于不支持大分区、FAT32、长文件名等技术，会给你带来大量的麻烦。建议大家使用Norton Utilities4或更高版本中的NDD.EXE，这是纯DOS下的工具。在硬盘崩溃或异常的情况下，他可能可以带给用户以希望。WIN9X下的磁盘医生调用的并不是这个程序，而是NDD32.EXE。